《科学小飞侠 THE MOVIE》系1972年放送的科学小飞侠系列的剧场版作品，于1978年7月15日上映。

在另一时空，索伦博士正阴谋毁灭星球，攻击进取号。唯一能够帮助新舰长皮卡德来阻止索伦的，只有销声匿迹了78年的柯克船长。

南方破败小镇的养老院里住着一群被“抛弃”的老人。阿贵今年78，从没上过学，也没娶过老婆。在养老院这个“家园”里也有鄙视链——养老院里组织春节互相送小手工的活动，“人气老头”络绎不绝有老太太来送礼物，可阿贵等到了天黑，也没有得到任何一个人的礼物， 最终和“人气老头”大打出手。大年30的晚上，养老院来了辆救护车，阿贵喝了农药，阿贵不想再孤独地活在这世上。阿贵被救起以后，却突然走了桃花运，手机上有个叫“佩兰”的老太太加了他...

《科学小飞侠》这部动画的原作是吉田龙夫（漫画家出身，后来投入动画制作而成立龙之子制作，已故），由鸟海尽三与陶山智负责企划。本片当初是以与巨大机械战斗的低年龄向动作片为起点，但在导入公害、科学、战争等现实中的严肃题材，与亲情及角色过去的戏剧性，这些非儿童导向的故事都博得好评，因而得以将预定的一年播映期延长，并成为龙之子制作的SF英雄动画类型经典代表作。

在「破晓起义」后前往地球的夏亚，在那与拥有不可思议力量的少女──拉拉．逊相遇。另一方面，致力推动RX-78开发计划的阿姆罗父亲──提姆･雷，得到吉翁方面MS开发计划的核心人物──米诺夫斯基博士逃亡的消息，因而动身前往月球。在月球表面上的微光区域，展开人类史上首次的MS死斗战。时间来到宇宙世纪0079年——。距离地球最远的宇宙都市SIDE 3，以吉翁公国之名向地球联邦政府挑起独立战争。这场战争导致人类的总人口数一半死去，动乱的时代正要开始——。